Отдел (до февраля 2016 года организационно-аналитический отдел) был создан в 2006 году под руководством к.б.н. В.П. Князевой. С июня 2016 года отделом руководит к.б.н. Н.Н. Тинаев.

По заданию Россельхознадзора отдел осуществляет систематический сбор информации о работе ФГБУ, подведомственных Россельхознадзору, работающих в области карантина растений, и на основании полученных данных подготавливает сводные отчеты и аналитические материалы о работе учреждений.

Ведется постоянная работа по взаимодействию с филиалами ФГБУ «ВНИИКР» с целью обеспечения контроля и помощи в выполнении производственных задач. Регулярно обрабатываются данные о производственной работе филиалов ФГБУ «ВНИИКР», проводится анализ данных и подготавливается сводная отчетность.

Обеспечивается организация выполнения работ по госзаданию в рамках контрольно-надзорных мероприятий территориальных управлений Россельхознадзора и карантинного фитосанитарного мониторинга в рамках реализации мероприятий Россельхознадзора для обеспечения выполнения требований Соглашения ВТО по СФС.

Подготавливаются годовые отчеты о производственной деятельности филиалов ФГБУ «ВНИИКР» и ФГБУ, подведомственных Россельхознадзору.

По заданию Россельхознадзора информационно-аналитический отдел еженедельно собирает оперативную информацию о работе территориальных управлений Россельхознадзора по следующим направлениям:

• обнаружения КВО при ввозе подкарантинной продукции на территорию РФ и принятых мерах;
• нарушения международных и российских фитосанитарных требований при поставках подкарантинной продукции на территорию РФ;
• нарушения правил провоза подкарантинной продукции в ручной клади и багаже пассажиров;
• информация о ввезенном на территорию РФ семенном и посадочном материале.

Полученные данные обрабатываются и на их основе составляются аналитические и справочные материалы для Россельхознадзора.

Подготавливается аналитическая информация по результатам работ, проводимых подведомственными Россельхознадзору ФГБУ, для размещения на сайте учреждения.